La parroquia María Madre del Buen pastor en sus inicios empezó como parroquia de la divina Pastora en el año de 1925 fundada por los Misioneros capuchinos pertenecientes a la prefectura Apostólica del Caquetá y Putumayo.

El encano fue zona de misión de la comunidad Capuchina, que gracias a su trabajo se inicio la construcción del templo parroquial que hoy existe. Los trabajos de la construcción iniciaron en 1920 y pasaron casi 45 años para que el trabajo estuviera prácticamente terminado. En el año de 1920 se inicia la construcción de la capilla y de la casa cural. La obra al principio fue de madera; en 1931, ya con planos, se modifica la obra, siendo su construcción a base de ladrillo, cal y arena. La bendición de la capilla, se realizó el 24 de Diciembre de 1931, por Monseñor Miguel Gaspar Monconill y Viladot.

El 21 de abril de 1965 empezó a llamarse Parroquia de la Divina Pastora ya perteneciente a la Diócesis de pasto y dirigida por Monseñor Jorge Giraldo Restrepo y como parroco el padre Mario Anibal Vallejo Navarrete.
En 1995 por decreto de monseñor Julio Enrique Prado Bolaños se deja de llamar parroquia de la Divina Pastora y empieza a llamarse parroquia Maria Madre del Buen pastor.